在长期建设和发展进程中，形成了较为合理的产业结构，近年来三次产业结构比基本保持在1.5：38.5：60。工业基础较为雄厚，是全疆最重要的工业中心，已建成以石油化工、钢铁、电力、煤炭、纺织、建材等为支柱，以化工、制药、皮革、食品、家具加工等为分支的工业体系，工业重型化特征明显，全疆排名前50位的工业企业一半以上集中在乌鲁木齐。随着国企改革基本完成和民营企业的异军突起，乌鲁木齐新型工业化进程明显加快，工业经济呈现出新的生机和活力。2005年，全市工业实现增加值175亿元，同比增长17%。商贸服务业十分发达，第三产业在国民经济中的比重达60%以上。现已形成中山路、小西门、友好路等八大商圈，建成各类特色明显、功能完善、辐射全疆的商品交易市场166个，年交易额达270亿元，其中超亿元的有30家。华凌综合市场以年成交53亿元的销售额位居西北地区同行业第一。一大批国内外知名商业流通企业相继落户，新型商业业态大量涌现，传统商贸业正加速向现代物流业转变。2005年，全市第三产业实现增加值335亿元，同比增长13.1%。